下密院位于拉萨幸福路北面，东与墨如寺相连。占地面积为2100平方米（10.6庙）。下密院，藏语称“举麦扎仓”，是下部地区弘传密法之所，属藏传佛教格鲁派密院最高学府之一。下密院始建于1433年（藏历第七绕迥之水牛年），距今约五百七十年。系宗喀巴八大弟子（即：号称为绛噶哇大师的嘉祥曲桑、上座桑炯瓦、上府仁钦坚赞、上府强僧哇、垛丹·健白嘉措、格西喜饶扎、杰尊·喜饶僧格、格西白炯瓦）中的第七位杰尊·吉饶僧格所创建。杰尊·喜绕僧格生于1382年（藏历第六绕迥之水狗年），出生于后藏古尔玛地方。父名丹巴玛波，母名曲古扎西。幼年入纳塘寺依珠巴·吉绕堪钦为师受沙弥戒，研习各派教法，其中对香巴噶举教法造诣最深。1401年游学各地，来到前藏在色拉曲顶听宗喀巴讲授显密教法，深得精要。1419年（藏历第七绕迥之土狗年）秋，宗喀巴为哲蚌寺阿扎仓大威德金刚本尊开光后到色拉曲顶讲授密法。法会上宗喀巴大师对众弟子再三谕以：“吾之密法谁能继承弘扬之？”而无人敢承受。这时，杰尊·喜绕僧格起立恭答：“大师的密法，弟子能继承发扬！”宗喀巴甚悦，当即赐以各种密宗法器、经籍，并勉其勤奋弘扬，利益“有情”（即有生命的所有生灵）。