真菌纤维素指具有分解纤维素能力的真菌分解的纤维素。纤维素很难被分解，已知除真菌外，只有纤维素分解细菌及少数软体动物能分解它。在真菌中，从它们的异养生活实际过程中，可以看到许多种属能起这种作用，已知主要是野生型的曲霉、青霉、毛壳属(Chaetomium)、镰孢属(Fusarium)、木霉属(Trichoderma)、漆斑菌属(Myrothecium)，特别是所谓植物寄生菌和腐朽木材的真菌，如蜡伞属(Pleurotus)、奇果菌属(Grifola)、耙菌属(Irpex)、层孔菌(Fom-es)等，它们会造成褐色腐斑。据认为，它们分解木材的主要因素是它们可形成纤维素酶。