作物遗传多样性（genetic diversity），农学-作物学-作物种质资源-作物种质资源鉴定-作物基因型-作物遗传多样性，一个物种内变异丰富度和变异类型分布均衡程度的总称。特点作物遗传多样性是一个物种在不同环境下长期生存、繁衍，产生变异积累的结果，一个种群多样性越高，对环境变化的适应能力就越强。通常一个物种的生态位越低，多样性越丰富。一个物种多样性与所处生态环境的复杂性呈正相关，也与人类的干预、特别是驯化和育种活动密切相关，一般而言野生植物的多样性高于农家品种，而后者又高于现代育成品种。驯化只是保留了群体中的个别突变个体或基因型，现代育种淘汰绝大部分基因型，筛选保留了极个别的基因型，因此常引起作物遗传多样性的下降。由于现代杂交育种工作常将来自不同生态区、不同国家的品种（系）杂交，促进了不同群体间基因的交流，创制一些本土所缺乏的基因型，有时也会提高现代品种的遗传多样性，对非本土起源的作物作用更为明显。