生物系统模拟（networks and system simulations in biology），理学-物理学-〔物理学与其他学科的交叉〕-生物信息学，应用物理学上的复杂网络、非线性动力学等理论，基于实验上的相关数据，对生物系统的各种信号相互作用关系进行全局系统性的模型构建，从而进行定量的数学描述和讨论，并使模型预测能够反映出生物系统的真实过程，且定量研究生物系统随时间变化的动力学行为。当今生物学的研究离不开数值的计算，生物信息学对于大量的基因序列数据的处理分析是人类基因工程完成的必要前提。对于生物系统的研究，除要了解细胞内的组成外，更重要的是要知道细胞和组织等的动力学行为方式，揭示生命体系在不同条件下、不同时间是怎样的生理过程。实验手段大多数都是建立在静态的基础上去研究生物体如细胞内的特定信号的生理过程，很难从一个动态过程去观测并还原细胞内各种信号相互影响真实发生的情况。生物体细胞间和细胞内的信号通路非常复杂，“高通量”和基因测序等技术为人们揭示细胞内许多信号分子及其复杂的相互作用网络提供了可能。从系统的角度出发，结合实验和计算去研究生物系统的复杂动力学行为，即所说的系统生物学。