果树育种目标（fruit tree breeding objective），农学-园艺学-果树学-果树育种，对所要育成的果树品种在生物学和经济学性状上的具体要求。即新品种在一定的自然、生产和经济社会条件下进行栽培时应该具备的一系列优良特征和特性。果树育种旨在持续培育适应不同生态环境，可满足种植者、经营者（贮运、营销、加工）和消费者多方面需求，综合性状优异，具有更新换代价值的多样化、高级化品种。为有的放矢地选育新品种，在制定育种目标时应考虑如下问题：①符合优质、高产、省力、节本、安全、高效的果树产业发展方向，选育的新品种能以较少的投入获得较大的经济、社会和生态效益。②育种目标要充分考虑不同地区、不同树种的特色需求，主次分明，不强求完美无缺。如在苹果生产的北缘地带，寒害是影响苹果生存和正常生长发育的主要问题，其育种应将抗寒列为主要目标；在枣上，裂果、缩果和枣疯病对产量和品质影响最大，则应把抗病性作为主要目标。③要尽可能满足种植者、消费者和经营者多方面的需求，既要着眼于现实和近期发展需要，同时也应尽可能兼顾到长远发展的需要。基于上述考虑，果树育种目标可分为共性目标和个性目标两个层次。