跨膜螺旋预测(transmembrane helix prediction),理学-生物学-生物工程-蛋白质工程-蛋白质工程-蛋白质分子设计-蛋白质理性设计-蛋白质特殊局部结构预测,应用生物信息学、计算机模拟对螺旋跨膜蛋白中的疏水区域(跨膜)和极性区域(膜外)组成的特殊结构模式进行的预测。发展简史1982年,凯特[注]等根据各个氨基酸的疏水标度值,把氨基酸序列通过滑动的矩形窗转换成疏水图谱,设定合适的阈值,从而判定可能的跨膜区。而Von Heijine提出的“正电荷居内规则”被利用到跨膜蛋白的预测中,大大提高了其预测的准确性。已经开发出了一些方法:T0PRED法是第一个将疏水性分析方法和“正电荷内居规则”结合应用的预测方法。而SPLIT法则是根据统计的已知二级结构的跨膜蛋白中氨基酸的偏好性来预测跨膜蛋白结构的。MEMSAT法将氨基酸偏好性和动态规划法结合, 取得了较好的预测效果。随后,蛋白质家族信息的应用又进一步提高了膜蛋白结构预测的准确性,PHDhtm法就是第一个将这些信息用于膜蛋白结构预测的方法。