口腔微生物（oral microbes），理学-生态学-微生物生态学-〔微生物与动植物、人类关系〕-口腔微生物，定植于人体口腔的细菌、古菌、真菌、病毒等微生物的集合。口腔是外界连接呼吸道和消化道的通道，其适宜的温度、湿度、酸碱度和丰富的营养源，为微生物的栖息提供了适宜的条件。口腔微生物通常以生物膜的形式构成组分复杂的微生物群落。口腔微生物的多样性与群落组成与人体的健康具有相关性，口腔疾病及某些非口腔疾病皆可影响口腔微生物的生态平衡。口腔微生物多以细菌为主，口腔不同部位的微生物群落存在显著差异。在唾液中，主要的细菌类群是厚壁菌门，其次为变形菌门和拟杆菌门，再次为放线菌门和梭杆菌门。口腔真菌的种类和数量仅次于细菌，一些真菌也能引起口腔疾病，如念珠菌属（Candida）是导致鹅口疮的主要感染病原真菌。口腔微生物与宿主处于相对平衡状态时，可阻止致病菌的入侵，而口腔菌群失调，可诱发多种口腔疾病，包括最常见的龋齿、牙周病等，严重危害口腔健康。口腔微生物不仅与口腔健康紧密相关，还与糖尿病、类风湿性关节炎、心血管疾病等密切相关。