代谢标志物（metabolic markers），医学-现代医学-药学领域-药理学与药代动力学-代谢组学-代谢组学的临床应用-代谢标志物，能表征机体代谢、代谢通路特征变化的关键化合物。可从分子水平定性/定量揭示代谢循环特点和变化规律。代谢组学重点研究与机体代谢、代谢通路有关的规律性变化。代谢标志物是通过代谢标志物的变化来追溯生物体糖类、蛋白质、脂质、核酸等一系列分子的来源和去向，有利于揭示生命活动规律、生化反应机理、生理/病理变化特点、药效作用方式、毒性反应特征。定量测定代谢标志物水平，不仅可以表征生理/疾病状态，还能反应药效作用强弱、毒性反应程度，在科研和临床方面有广泛的应用价值。代谢标志物应用举例：①三羧酸循环（TCA）中乙酰辅酶A是生物体糖类、脂类和氨基酸代谢共有的中间产物（见图），通过测定乙酰辅酶A的氧化还原情况表征生物体有氧呼吸状况。②通过测定尿中吡啶诺林及Ⅰ型胶原N尾端交联肽和C尾端交联肽水平可反映骨Ⅰ型胶原的代谢。③通过生物体内蛋白代谢过程中产生的特异多肽序列来表征该蛋白降解水平。