分子记时器(molecular chronometer),理学-生物学-微生物学-微生物分类学-〔分子系统学 〕,能真实地记录生物的进化过程,使人们以此研究生物进化,描述各种生物个体或类群相互之间亲缘关系的分子标尺。作为生物进化记时器应满足相应的条件:①准确记录生物进化的过程。②记时器的分子在生物的演变过程要有变化,而这种变化是随机的。③变化的比例与生物进化的距离一致。④记时器要有足够的信息。20世纪70年代以前,生物进化主要是根据生物的形态结构、生理生化特性、行为习性等表型特征以及少量的化石资料来阐述的。当时生物进化的研究之所以没有取得突破性的进展,重要原因就是没有找到一把可以测量所有生物进化关系的尺子。虽然法国生物学家E.祖卡坎德尔[注]等于1965年首先提出基因作为分子钟(molecular clock)解密生物系统发育的关系,但未见实际研究报道。