蛋白质修饰（protein modification），理学-生物学-生物工程-蛋白质工程-蛋白质工程-蛋白质修饰，新合成的多肽及蛋白质在特定位点上所做的蛋白质酶切和化学修饰。包括磷酸化、乙酰化、甲基化、泛素化、糖基化及脂基化等。蛋白质修饰可以改变蛋白质的氨基酸序列和理化性质，影响蛋白质的空间结构和稳定性，使蛋白质的结构更加复杂多样，功能更为完善专一，机体调节也更精巧细致，对于生命体执行正常的生理功能具有十分重要的作用。另一方面，倘若上述复杂的修饰过程失去了控制，那么细胞的新陈代谢甚至个体的整体调控就会发生紊乱，产生致命的后果。