磷脂脂肪酸分析，是指基于生物化学手段的一种微生物生态学研究新技术。磷脂脂肪酸（PLFA）是活体微生物细胞膜的重要组分，周转速率快且随细胞死亡而迅速分解。不同类群的微生物能通过不同的生化途径合成不同的PLFA，部分PLFA总是固定出现在同一类群的微生物中，而在其他类群的微生物中很少出现。这些相对稳定出现的PLFA可以作为相应类群微生物的生物标记物来指示微生物量和微生物群落结构。PLFA方法的优点：可直接提取原位土壤，避免由培养和计数引起的偏差；与传统方法相比，能提供样品中所有微生物的信息，能快速处理大量样品，是一种快捷、可靠的分析方法。