粪便显微镜检查是临床常规检查的主要内容，用于检查各种有形成分，如细胞、寄生虫、结晶、细菌、真菌。许多寄生虫感染的疾病均可以在粪便中查到病原体—寄生虫卵或虫体。粪便中常见的虫卵和虫体有蛔虫、蛲虫、钩虫、绦虫、鞭虫、阿米巴原虫或包囊、血吸虫、肺吸虫、肠滴虫、蓝氏贾第鞭毛虫等。常用的寄生虫检查法有常规涂片镜检法和集卵法等。各种寄生虫感染的诊断指标。凡在粪便检查中查到虫卵，即能肯定有寄生虫感染。但当粪便寄生虫检查未查到虫卵时，并不能否认有寄生虫感染。因为一次化验可能因粪便取材不当或取样时间不当等因素未能查到虫卵，或因体内感染的虫体尚未排卵或排卵较少或为雄性虫体，则不能查到虫卵。