重组率（recombination frequency），农学-作物学-试验统计-作物试验统计方法-估计方法与算法-重组率，两个标记或基因座位之间发生奇数次交换的概率。直观上反映了两个基因座位间的遗传距离。重组率的估计是遗传研究中的经典问题。连锁图谱是指基因或标记在染色体上的相对位置与遗传距离。遗传距离一般以厘摩（centi-Morgan，cM）表示，1%的重组率对应的遗传距离定义为1厘摩。世界上第一张遗传连锁图谱是利用5个形态特性标记构建的果蝇X染色体（Sturtevant，1913）。现在的连锁图谱一般都包含成百上千个标记。建立在重组率估计之上的连锁图谱是开展遗传研究、基因定位、精细定位和克隆的前提。两个座位之间的重组率多利用双亲群体进行估计，多采用极大似然原理。一般步骤如下：首先，根据概率论和遗传学原理，推测遗传群体中各种基因型的理论频率，即建立两个座位上基因型频率与重组率之间的关系；然后，构造多项分布的样本似然函数。有些群体可通过似然函数或对数似然函数求导数、并令导数等于零，得到重组率估计的显式解。