病毒以外的微生物的计数。样品中可测到总的(死的和活的)细胞数，称为总细胞数(total cell count)，样品中可测到的活的细胞数称活细胞数(viabltcell count)。总细胞数可用电子仪器或直接计数法测定。含有低细胞浓度的液体样品。可以用膜过滤并在膜上对细胞染色，在显微镜下计数活细胞数的测定。可由:(!)在计数室内测定用活体染色剂染色的样品，(2)稀释平板法:(3)菌落计数，样品中活细胞数目由接种了样品的，发育在适合培养基上的菌落数目推定。培养基和(或)培养条件的选择，可以极大地影响形成菌落的活细胞数。某些类型的细胞，趋向于丛生或链生，这些微生物的准确的活细胞计数不能用上述方法，可依据“单位体积菌落形成单位，(cotony-formingunit/ valwne)来计数。 上述方法，一般适用于大部分细菌和泡子计数，其中一些方法，’可用于某些藻类、真菌和原生动物。在显微镜下，计数迅速运动的原生动物，可以用粘性悬浮培养基，如2-5I甲基纤维素。降低它们的运动逮度。