《理学宗传》是孙奇逢的代表作，也是一部我国较早的全面系统阐述儒家人物的学术思想史专著。从编写到成书历经30年，贯穿了孙奇逢一生的重要经历。该书将自汉至明末著名学者 分为三类，“有主有辅，有内有外”。第一类为理学发展的宗统，是主线，计11人，分别为 周敦颐、程颢、程颐、张载、邵雍、朱熹、陆九渊、薛瑄、王守仁、 罗洪先、顾宪成；第二类为各代名儒，为辅，主要有董仲舒、申公培、倪宽、毛公苌、王通 及其门人、韩愈及其门人、杨文靖及程门弟子、朱门弟子、陆门弟子等；第三类为与理学道 统相背者。按人立传，摘其语录、著述，加以评述，充分展现了孙奇逢的理学思想。他从宗 主王阳明到“不分门户”、“兼容并包”、“各取其长”、“皆供吾用”，对朱王之争采 取了“相互补救”、“朱王合一”的态度，从而为陷入困境的宋明理学开辟了一条新的道路 ，开创了儒学发展的新境界。