现在，基因组指自主复制的单所有多的位所应有的一套基因，因而有 质粒基因组 和 病毒基因组 的名称，这和 质粒和病毒的不可染色体 一词相同。基因组中不同区域具有不同的功能，有些是属于编码蛋白质的结构基因、有些属于参与结构基因的复制、转录及其蛋白质表达调控的调节基因，有些功能目前还尚不清楚。基因组(genome): 有关特定生物全部染色体的遗传物质的总和，DNA 碱基对总数来表示。对单倍体而言，基因组表示这种生物的总DNA; 对于二倍体的高等生物，其配子的DNA总和即为一组基因组。二倍体有两份同源的基因组，真核生物细胞中有几个染色体，故有几个基因组。细菌的基因组是惟一的染色体。