鼓楼区人民检察院成立于1956年7月，配干部6人，其中检察长1人。翌年，增配副检察长1人。1968年，"文化大革命"中鼓楼区检察院被撤销。1979年1月，复设鼓楼区人民检察院，配干部6人，其中正、副检察长各1人。1980年，内设办公室、刑事检察科和经济检察科3个科室。1994年，内设机构有办公室、刑事检察一科、刑事检察二科、控告申诉检察科、民事行政检察科、法纪检察科、反贪污贿赂工作局、法律政策研究室、监所检察科、政工科等10个科室。共有干警66人，其中检察长1人，副检察长3人，检察员22人，助理检察员30人，以及书记员、法警等。