药用资源系统生物学（system biology of medicinal resources），医学-现代医学-药学领域-生药学-分子生药学-药用资源功能基因组，从整体层次上研究药用资源所有组成成分（基因、蛋白质、代谢物、生物小分子等）的构成，以及在特定条件（如遗传的、环境的因素）变化时，这些组分间的相互关系，并分析这一生物系统在一定时间内的动力学过程的学科。随着人们对药用资源需求的增加，过度开采导致很多药用植物产量持续下降，甚至有一些珍贵药材已经濒临灭绝。但也有很多药材正处在有待开发的阶段。为了更好地利用药用资源，实现药用资源的可持续利用，必须对药用资源进行保护性开发，并完善生态环境的保护工作，要全面理解药用资源及其所在系统、药用资源生物体内各种分子（核酸、蛋白质、小分子化合物）及其相互作用，合理利用药物资源，以及可持续开发。因此，药用资源系统生物学应运而生。基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、相互作用组学和表型组学构成了药用资源系统生物学的主要技术与平台。