《福建医科大学学报》创刊于1959年，是由福建医科大学主管、主办的医药卫生综合类学术期刊，面向中国国内外公开发行。根据2019年3月《福建医科大学学报》编辑部官网显示，《福建医科大学学报》编辑委员会常务编委有15人、委员有90人。据2019年3月3日中国知网显示，《福建医科大学学报》共出版文献6999篇、总被下载351891次、总被引15817 次、（2018版）复合影响因子为0.561、（2018版）综合影响因子为0.495。 据2019年3月3日万方数据知识服务平台显示，《福建医科大学学报》载文量为3277篇，基金论文1331篇，被引量为9915次，下载量为100576次；根据2015年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，《福建医科大学学报》影响因子为0.442。1959年10月1日，《福建医学院学报》创刊。