球等鞭金藻是单细胞生活的个体，细胞裸露，形状多变，但大多数呈椭圆形，幼细胞有一略扁平的背腹面，故侧面观为长椭圆形或长方形。细胞前端生出两条等长的尾鞭型鞭毛，鞭毛平滑无附着物和膨胀体，其长度为细胞的1-2倍。鞭毛基部有液泡。细胞内具有2个大而伸长的侧生色素体，其形状和位置往往随体形而改变。一个暗红色、卵圆形的眼点位于细胞中央，偶有靠近细胞前端。细胞核一个，通常位于细胞中间。贮藏物是油滴和白糖素，小油滴分布在细胞质中，白糖素位于细胞后端，一般为2-5个小块。一般活动细胞长4.4-7.1微米，宽2.7-4.4微米，厚2.4-3微米。球等鞭金藻主要进行无性二分裂繁殖。定鞭金藻纲，等边金藻科。单细胞运动