动物声呐监测（animal monitoring by sonar），理学-生态学-〔生物多样性与保护生态学〕-保护生态学-〔生物多样性编目与监测〕-生物多样性监测-声呐监测，利用声波对动物进行探测、定位和识别的技术。主要用于水生动物和蝙蝠的监测和研究，分为主动声呐监测和被动声呐监测。主动声呐监测的原理和回声探测类似，通过主动发射多个独立声波、并监测回波来探测目标。对于水生动物（如鱼类）的监测主要采用主动声呐系统，相较于传统的拖网捕获和鱼探仪技术，声呐技术可实现对目标的跟踪和定位，而且精度更高；与水下光学成像技术相比，声呐技术探测范围广、受水体透明度影响小、探测率高，因此被广泛运用于水下研究。通过声呐成像，可以获得动物的种群数量、体长、体型等生物学特征，还可以实现对目标动物的定位、获得运动轨迹和空间分布信息。声呐系统的分辨率和波速频率有很大关系，频率越高的声波在水中衰减越快，探测距离就越短，因此需要根据探测目标选择合适的声呐频率。在海洋鱼类和海洋底栖动物生态学研究中使用较多的是双频识别声呐（dual-frequency identification sonar，简称DIDSO）。