珊瑚礁微生物(coral reef microbes),理学-生态学-微生物生态学-微生物生态类群-水域微生物-海洋微生物-近海海洋微生物-珊瑚礁微生物,在热带和亚热带浅水海洋生态系统中与珊瑚礁紧密共生的微生物。最为常见的珊瑚礁微生物是玫瑰杆菌(Roseobacter),其次是鲁杰氏菌(Ruegeria)、α-变形菌(Alphaproteobacteria)。珊瑚礁微生物作为生产者和分解者参与物质循环、能量流动,调节珊瑚礁生态系统的平衡与稳定,是该生态系统食物网中最为基础和活跃的一环。它们在珊瑚礁生态系统的生物地球化学循环和健康维护上具有重要作用。珊瑚礁的黏液、外周海水以及海底沉积物中的微生物一起组成了珊瑚-微生物共生体。黏液层含有丰富的蛋白质、脂类、多糖以及溶解态有机物,不仅为微生物提供理想的栖息环境,也为微生物的附着提供便利和保护。宿主珊瑚与微生物之间专一性的存在是维持共生体稳定的前提,然而珊瑚的生活史周期较长,在动态环境的变化下共生体的组成与比例会有一定的变化,同时二者还存在协同进化的可能。