药用作物育种（medicinal crops breeding），农学-作物学-作物-药用作物-药用作物育种，对药用作物自然发生或通过人工方法创造的遗传变异进行选择，改良药用作物的遗传特性，从而育成优质品种的过程。又称药用作物遗传改良。简史药用作物栽培历史悠久，但多因栽培规模不大，因此遗传改良研究工作起步也相对较晚。引种自野生和经长期栽培条件的药用作物群体中存在许多丰富的变异类型，尤其对于栽培历史较长的药用作物也有种类多样的农家类型。中国有栽培药用作物约300种，这些种由于栽培历史悠久。劳动人民在生产实践过程中，根据长期积累的经验和发现的种内变异类型，经过调查、整理、系统评价从中发现一些优良种质和栽培类型，并从这些变异类型中优选出遗传性相对稳定的药用作物优良品种。