生物工具种（tool species），理学-生态学-恢复生态学-〔基本概念〕-生物工具种，在生态恢复或环境修复时，能够起到工具的作用效能，具有特殊的生物生态特性的物种。在生物恢复技术中，常采用生物工具种进行生态恢复或环境修复。作为特定退化生态系统恢复或环境修复的生物工具种，应具有较强的针对性和较高的敏感性，应用后效果显著。对于某种重金属污染地的环境修复，可以使用对此重金属具有高富集作用的植物作为生物工具种，环境修复效果好。对土壤营养极度贫瘠的退化地，若进行森林植被的恢复与重建，可以选用具有固氮功能的豆科植物作为生物工具种，豆科植物相思属（Acacia）、合欢属（Albizia）的许多种常作为生物工具种应用于极度退化林地的生态恢复；田菁（Sesbania cannabina）常用于退化农田的恢复。生物工具种在改善林地环境、建立先锋群落中起到重要的作用。