巴布亚诸语言(英语：Papuan languages)是指在巴布亚新几内亚及邻近地区流通，但不属于南岛语系的多种语言的集合。由于这个语系内有多达6000多种不同的语言，而语言间的差异又很大，有不少语言学家都认为现时的分类其实未是最完善的，只是临时应用的一种分类。主要分布于新几内亚及其周围地区的近700 种语言，其次还分布于西起阿洛尔群岛、哈马黑拉岛和帝汶岛，东达圣克鲁斯群岛的大片地区。美国有的语言学家把它们称为印太诸语言(Indo-Pacific languages)或非南岛诸语言 (Non-Astronesian languages)。鉴于语言识别的工作难度很大，尤其是西伊里安等地区的语言，目前仍鲜为人知，因此对巴布亚诸语言数目的统计分歧较大。较早的说法是150种以上，后来有人说500多种。美国人类学语言学家B.F.格兰姆斯编辑的《人种学家眼中的世界诸语言》(1984)列举了696种（包括1种已消亡的语言）。比较普遍的说法是650种以上或近700种。但得到比较可靠识别的语言不过650种，使用这些语言的人共约250万。