核心多糖由庚糖、半乳糖、2-酮基-3-脱氧辛酸(2-keto-3-deoxyoctonic acid,KDO)等组成，所有革兰氏阴性细菌都有此结构·类脂A是以脂化的葡萄胺二糖为单位，通过焦磷酸酯键组成的一种独特的糖脂化合物，具有致热作用，是革兰氏阴性细菌内毒素的毒性成分。革兰氏阴性细菌细胞壁较薄，厚约10-15nm,结构也较复杂.肽聚糖含量低，仅占细胞干生10%左右，层薄又较疏松，因肽聚糖之间仅四肽侧链直接联结，缺乏五肽桥;肽聚糖居于细胞最内层，外面由内向外还有脂蛋白，外膜和脂多糖的三层聚合物.