煤系岩石中可反映沉积环境的古生物特征。不同生物组合指示水盆地的含盐度、古水深和古水温等沉积环境。根据现代海洋和陆地不同环境其生物群和生态特征不同的现象,运用将今论古的类比方法,可据以推断古代地层中生物生活时的环境。绝灭门类的化石所反映的沉积相,通常根据其共生组合、沉积物分布和岩性特征进行判断。古生物化石是区分海相和非海相环境的突出标志。①高等植物化石的大量出现是陆相的标志。②沿层面分布的完整的植物叶部化石,指示湖泊等平静的水体环境。③植物根部化石大量出现,是沼泽相的特征。④大量植物碎片的出现,则可能是河流边滩或浅湖沉积。⑤树干常见于河床沉积物中。⑥孢子花粉主要见于陆相和过渡相沉积。⑦在藻类化石中,蓝绿藻适应能力最强,它可在不同环境中生存; 叠层状,表明海和盐湖环境; 而树枝状或分离的团块状藻类,则是淡水环境的特征;绿藻中海松科和伞藻科以及红藻,是海相的,而轮藻则主要是陆相的。⑧脊椎动物化石中除了一部分鱼之外,主要指示陆相。