沙克尔顿陨石坑（Shackleton）是位于月球南极的一座撞击坑，其地质龄大约有36亿年，在南极至少已存在了20亿年。其名称取自盎格鲁爱尔兰人南极探险家欧内斯特·亨利·沙克尔顿爵士(1901年-1922年)，1994年国际天文学联合会批准接受。该陨坑位于南极-艾特肯盆地内，环周边分布的醒目撞击坑有舒梅克环形山、霍沃思环形山、德·杰拉许陨石坑、斯维德鲁普陨石坑、斯莱特陨石坑、福斯蒂尼陨石坑；以及距它稍远，位于月球正面东半部以二位早期南极探险家所命名的更大的陨石坑-阿蒙森环形山和斯科特环形山。沙克尔顿陨石坑中心月面坐标为89.67°S 129.78°E，直径20.92公里，深度约4.2公里。月球的自转轴点就位于沙克尔顿陨石坑内距中心点仅几公里处。