斗六厅为台湾日据时期行政区划,设立于1901年,台湾总督府以办务署负责地方政务,而县及厅介于总督府与办务署之间,造成行政事务上的欠缺灵活 ,而废止“三县四厅”,设“二十厅”之行政单位,将原先的台中县分为苗栗、台中、彰化、南投、斗六等五厅,斗六厅治设于斗六堡斗六街,管辖斗六堡、溪洲堡、他里雾堡、沙连堡、鲤鱼头堡、西螺堡、打猫东顶堡、打猫北堡、大槺榔东顶堡、尖山堡、海丰堡、布屿堡、大丘田堡、白沙墩堡、茑松堡。设立林圯埔(1901年设有劳水坑支厅,于1904年并入林圮埔支厅)、土库、西螺、北港、下湖口、仑背等六支厅。1909年10月,台湾总督府将原有之二十厅合为十二厅,斗六厅废止,林圯埔支厅(沙连堡、鲤鱼头堡)并入南投厅,其余并入嘉义厅。