阿勒泰鱥，脊索动物门-鱼纲-鲤形目-鲤科。背鳍iii-7；臀鳍iii-7；胸鳍i-14；腹鳍ii-7。侧线鳞32—42.，纵列鳞78—82。第一鳃弓外侧鳃耙7—8。下咽齿2行，2·4—4·2。脊椎骨4+35。 体长为体高的4.3-4.6倍，为头长的3.7-3.8倍，为尾柄长的4.1-4.4倍，为尾柄高的9.6-11倍。头长为吻长的3.7-4.2倍，为眼径的3.7-4.2倍，为眼间距的2.8-3.0倍，为尾柄长的1.1-1.2倍，为尾柄高的2.6-3.0倍。尾柄长为尾柄高的2.3-2.6倍。 本亚种与指名亚种主要区别是尾柄较高，尾柄长为尾柄高的2.3-2.6倍，指名亚种为3.0-3.3倍。