蛋白质简化物理模型

蛋白质简化物理模型（simplified physical models in protein simulations），理学-物理学-〔物理学与其他学科的交叉〕-分子生物物理学，通过对蛋白质的组成、结构、相互作用以及动力学进行物理简化而实现的用于描述特定物理过程的模型。蛋白质体系具有复杂的相互作用。因此其动力学表现出丰富的多尺度特点。针对组成的简化模型，就是构建一个较小的单元种类来模拟自然界的20种氨基酸，如HP模型就是仅考虑疏水和亲水类型的单元。这种简化常常是通过分类来实现的。这样可以有效减少体系种类数目，可以突出关键的相互作用。在各种相互作用简化的模型中，一种很重要的模型是Go模型。这一模型是由日本科学家N.Go提出的，并在最小阻错原理提出后，得到了广泛应用。这一模型中仅考虑天然态中所出现的吸引相互作用，从而有效保证天然态的稳定性，也充分反映了天然结构对蛋白质结构和动力学的重要作用，成为蛋白质物理研究的一个重要手段。在这一模型中通过引入蛋白质序列引起的相互作用异质性，成功解释了打结蛋白的折叠等问题。