药用资源发育机制（developmental mechanisms of medicinal resources），医学-现代医学-药学领域-生药学-分子生药学-药用资源功能基因组-药用资源转录组，药用资源个体所经历的生长全过程的控制机理。药用植物资源发育过程从受精卵的最初分裂开始，经过种子萌发、根茎叶营养体形成、花形成、传粉和受精、结实，直至衰老和死亡的过程。药用动物资源发育过程也经历从受精卵分裂开始，形成桑葚胚、囊胚、原肠胚、外胚层、中胚层、内胚层进而形成组织、器官，直到完整个体的出生、生长和死亡的过程。药用资源的发育不仅受到其基因组的控制，也会受到所处生长环境的影响。因此，对药用资源发育机制的研究也涉及包括药用资源基因组、药用资源转录组、药用资源蛋白质组、药用资源表观组和药用资源代谢组等多组学技术。对这些多组学数据的系统分析是阐释药用资源发育机制的关键，也是人为调控、干扰发育进程的方法。药用资源发育过程在自然情况下是不可逆的，但依据对药用资源发育机制调控的研究，药用植物资源可以利用脱分化、药用动物资源可以通过重编程实现发育的可逆，从发育后期状态转变为原始状态。