大肠杆菌基因组(Escherichia coli genome),理学-生物学-微生物学-微生物基因组学,大肠杆菌具有的所有遗传信息的总和。大肠杆菌为革兰氏阴性细菌,是研究生命体系的基本生物学过程和机制的模式生物,该菌与人类关系密切,部分菌株具有高致病性,同时大肠杆菌是最为常用的表达重组蛋白的宿主,因此具有重要的理论研究和实际应用价值。毫无疑问,大肠杆菌是当之无愧的最重要微生物之一。截至2021年9月,共有816个不同大肠杆菌菌株的全基因组(大小为4.5~5.9兆碱基对)被公布。美国学者F.R.布莱特纳于1983年首次提出测定大肠杆菌基因组,经过多年努力,他的研究组于1997年发表了非致病性大肠杆菌K12标准菌株MG1655的全基因组序列。MG1655菌株基因组的大小为4.6兆碱基对,不含质粒,预测具有4288个蛋白编码基因,共覆盖约88%的基因组序列,约40%的基因功能未知,所编码蛋白的平均大小为317个氨基酸残基,其中最大的为具有2383个氨基酸残基的一个功能未知蛋白。