淡水藻类病毒（algal virus in freshwater），农学-渔业-水产养殖-水产养殖病害-[淡水养殖病害]-淡水养殖病毒性疾病-淡水藻类病毒，可感染藻类的一类病毒的统称。类型藻类有原核藻（如蓝藻或称蓝细菌），也有真核藻（如绿藻）。感染原核藻的病毒为蓝藻病毒，或称噬藻体；而感染真核藻的病毒为藻病毒。大部分淡水噬藻体由无囊膜头部与尾部组成，呈蝌蚪形，属有尾噬藻体目成员，可分为长尾噬藻体科、肌尾噬藻体科和短尾噬藻体科。长尾噬藻体科病毒头部为等轴或延长的二十面体结构，直径50～70纳米，具有较长的尾（有些尾长达580纳米）和无收缩性短尾鞘。肌尾噬藻体科头部为二十面体，直径50～110纳米，有可收缩尾部，长80～450纳米，尾部结构复杂，尾鞘收缩后可暴露出尾髓。短尾噬藻体科病毒头部是等轴对称二十面体，直径为50～60纳米，有的尾长约15纳米。2009年，中国科学院水生生物研究所开始分离培养了不同噬藻体，并测定了淡水铜绿微囊藻噬藻体、鱼腥藻短尾噬藻体及浮丝藻噬藻体等的全基因组序列。