微生物呼吸(microbial respiration),理学-生态学-微生物生态学-微生物生态功能-微生物元素转化-微生物碳转化-微生物呼吸,微生物通过体内有机物的氧化反应获得能量的代谢过程。不同的微生物能分别利用葡萄糖或其他小分子有机物或无机物为底物,以氧气(O2)、无机物或小分子有机物为最终电子受体,通过生物氧化获得能量。根据最终电子受体的不同可将微生物的呼吸作用分为有氧呼吸、无氧呼吸和发酵三种类型。有氧呼吸以O2为最终电子受体。化能异养菌以有机物(主要是葡萄糖)为底物,在氧化有机物过程中,将电子传递给O2,获得能量。化能自养菌以无机物为底物,通过氧化无机物获得能量。比如,硝化细菌以氨(NH3)、亚硝化细菌以亚硝酸根离子(NO2-)为底物。有氧呼吸的微生物多为好氧菌,部分可为兼性菌。无氧呼吸以无机氧化物为最终电子受体。这类微生物生活在缺氧的环境中,以无机物作为有机质氧化的最终电子受体。例如,反硝化细菌以硝酸根离子(NO3-)、反硫化细菌以硫酸根离子(SO4-)为电子受体。发酵以有机物为最终电子受体。作为最终电子受体的有机物,通常是底物不完全氧化的中间产物。