黑疣柄牛肝菌，子实体中等至大形。菌盖直径7-14cm，半球形至扁半球形，湿时粘，土黄色，具绒毛，幼时粗糙有皱或凹凸不平，后期深龟裂。盖边缘表皮明显延伸，当幼时形成领口状，老后开裂。菌肉白色，厚，坚实，受伤处在基部时变为淡紫色，而盖部菌肉变为淡黄色。菌管长0.8-2.3cm，近姜黄色，老后黄绿色，常离生。管口微小，直径小于1mm，与菌管同色。菌柄粗壮，近圆柱形，长6-12cm，粗2-4.5cm，黄色，有时向上渐变细，内部实心。孢子黄褐色，长圆形至卵圆形，9-12(14)μm×3-4.5cm，多为11μm×4μm。管侧囊体近棱形， 30-56μm×5-9.5μm。