基因组步查法是用以鉴定已经克隆的特定DNA片段侧翼顺序的方法。用已经被鉴定的特定DNA片段一端或两端的末端片段为探针去筛选基因组DNA文库,对已被鉴定的DNA一端或两端并与之重叠的克隆进行筛选与鉴定。然后用新鉴定克隆中与原始克隆DNA非共有的一端的片段作探针,进行新的筛选与鉴定。依次类推,可以弄清跨度为几百个kb的连接片段。DNA文库严格来讲应称作cDNA文库,中文名称是基因文库,是指某生物基因组中所有可表达的基因片段,经mRNA反转录后获得相应的cDNA的集合,将这些cDNA的集合经转入和克隆后贮存于受体细胞群落中,这个受体细胞群落即构成该生物的cDNA文库。