清分系统（clearing system），工学-土木工程-城市轨道交通工程-城市轨道交通运营管理，负责不同城市轨道交通运营主体间的清分精算，即收集、统计和分析运营数据，通过制定并执行清分规则，实现对各条线路以及城市一卡通、银行、移动支付平台等其他第三方系统收益数据的精确和完全结算的系统。作用清分系统可以建立兼容公钥私钥体系和基于SAM卡的安全密钥体系，生成系统密钥，进行密钥管理，通过制作、发行系统内部使用的票卡，并对交易数据进行清分来实现“一卡通”，同时也可以与城市一卡通系统互联互通，实现更大范围的“一卡通”。清分系统属于城市轨道交通自动售检票系统中的一个层次，在网络运营条件下，可满足城市其他行业收费系统在路网内的统一应用，实现不同运营商经营线路间的互联互通。