瓦伦原理（Wahlund's principle），理学-生态学-〔分子与进化生态学〕-分子生态学-群体遗传学-〔遗传结构〕-瓦伦原理，在种群遗传学中，揭示种群结构的存在导致杂合度降低的原理。又称瓦伦效应。由瑞典遗传学家S.瓦伦[注]于1928年提出。S.瓦伦指出，当一个种群被分割成了多个亚种群时，如果各亚种群等位基因频率不相同，那么种群的杂合度将会低于哈代-温伯格（Hardy-Weinberg）平衡下的期望杂合度。考虑一个最简单的种群分割情形，即一个种群被分割成了种群大小分别为和的两个亚种群，每个亚种群都符合哈代-温伯格平衡。