物元理论是指研究物元及其变化规律的理论，是物元分析的理论支柱之一。物元理论主要研究事物的可变性，研究事物变化的条件、途径和规律，探索事物转化的过程，通过物元变换来寻求解决问题的方法。物元理论还研究事物和系统的结构，特别是把结构的改变看成是解决问题的一种方法，通过结构变换和结构分析解决不相容问题。物元理论认为一个事物具有多种特征，而某一特征又为多种事物所具有。在进行物元分析时，必须注意到，某一问题对于事物的这一特征是不相容的，而对于该事物另一特征却可以是相容的。或者，某一问题对于这个事物的这一特征是不相容的，而对于具有同一特征的另一个事物却可以是相容的。例如，中国古时候有一个“傻子扛竹竿，过不去城门”的故事，就是傻子不懂得把竹竿的特征“高”转换为特征“长”的方法，这种变换事物的方法，也是决策者所常常用到的。