批注本是古代印刷批注和手写批注的刊本。批注本， 指学者将其校勘注文或心得体会附记于某些古书的一种刊本。包括印刷批注和手写批注两种。前者是在刊印书籍的同时将批注附人，如清代雷丰撰，陈莲助批注的《加批时病论》。后者是在刊本上用墨笔(或朱笔)手书批点校注、如明万历三年〔1575)袁表刊到的王叔和《脉经》。19世纪日本医家小岛学古曾有三色点校本。据杨守敬《日本访古志》云：“此书余得之小岛，朱蓝墨笔校记：其朱笔者，据员定何任本；蓝笔者，据明推阳刊本；墨笔者则据《素》、《灵》、《难经》、《伤寒》、《甲乙》等书，可称桔详。每卷后有学者校读年月，并记与其友人同睹姓名，盖不亩二四复校。”杨守敬得此书后，又旁引他书、再次以朱笔作了校注原因，其版本价值更高。