专访:安诺优达总裁陈重建,告诉你不一样的NextSeq 550AR
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导读
2017年3月10日,安诺优达基因科技官网发布新闻,安诺优达生产的NextSeq 550AR(国械注准:20173400330)及胎儿染色体非整倍体(T21、T18、T13)检测试剂盒(国械注准:20173400331)已经获批CFDA的医疗器械产品注册。转化医学网有幸邀请到安诺优达首席执行官兼总裁陈重建博士接受我们的访谈。以下是访谈内容:
陈重建 博士 安诺优达首席执行官兼总裁
转化医学网:近日,安诺优达生产的基因测序仪NextSeq 550AR及试剂盒获批CFDA产品注册,能请您介绍一下这款测序仪吗?
陈重建博士:NextSeq 550AR是安诺优达与美国Illumina公司联手打造的新一代桌面式高通量基因测序仪。NextSeq 550AR具有通量高、速度快、数据精准、性能稳定、操作简单等优点,可广泛应用于各级医疗机构、临检中心和科研院所,能够更好地服务于中国临床检测及科学研究。
NextSeq 550AR配合安诺优达同时获批的胎儿染色体非整倍体(T21、T18、T13)检测试剂盒,可以向临床提供更优质的无创产前DNA检测服务。NextSeq 550AR单次可检测96个无创产前DNA检测样本,实验流程及操作十分简单,检测时间也大大地缩短,可以更好的满足临床对无创产前DNA检测项目开展的需求。
转化医学网:据我们了解,临床上应用于无创产前DNA检测还有其他测序平台,请您简要介绍一下?
陈重建博士:目前国内临床开展无创产前DNA检测的测序平台主要有两类,分别是基于Illumina公司的NextSeq平台及Life公司的Ion Proton平台。
NextSeq平台采用Illumina研发的双通道“边合成边测序(SBS)”技术和经典的“可逆末端终止子”专利技术,为数据的准确性和稳定性提供了保障,在单碱基检测的准确率也就是Q30指标上要明显高于同类测序仪;同时仪器高度集成,测序过程中不需要其他辅助设备即可完成测序,不需要人工参与;操作简单,易于掌握。
无创产前DNA检测技术的研发及早期的临床试验开展都是基于Illumina公司的测序平台,在临床适用性及检测准确率方面的优势已经充分得到了验证。NextSeq平台在运行无创产前DNA检测项目上最大的优势是检测通量高,单次运行可以检测96个样本,是Ion Proton平台检测样本量的6倍左右。对于目前临床开展无创产前DNA检测这种大样本量的筛查项目,检测通量是临床的重点需求之一,较高的检测通量同时也意味着人力及试剂成本的节约。
基于Ion Proton平台的几款测序仪在运行无创产前DNA检测项目上单次可以检测16个样本左右,对于样本量较小的医院比较适用。但目前根据卫计委最新的政策规定,无创产前DNA检测项目应以有产前诊断中心为核心开展,其下面覆盖及合作的筛查中心可作为其采血点,样本量面临大幅度增长是所有产前诊断中心面临的问题,对于自建实验平台的产前诊断中心,若采用Ion Proton平台测序仪,则需要多台仪器才能够满足大样本量的检测需求。
转化医学网:从您刚才的介绍得知,NextSeq 500同样是基于Illumina 的NextSeq测序平台,它们之间有什么区别呢?
陈重建博士:的确两台仪器都是基于Illumina的测序平台,且同属于其NextSeq系列。Illumina于2014年发布NextSeq 500测序平台,2015年推出其升级版NextSeq 550,安诺优达NextSeq 550AR则是基于升级版的NextSeq 550平台进行开发的。NextSeq 550AR平台在软硬件方面均有升级,一方面使用升级版的光学成像模块,减少仪器故障率,运行更可靠;同时使用新版V2测序试剂,测序质量更好。
配合基于新版V2测序试剂研发胎儿染色体非整倍体检测试剂盒,NextSeq 550AR平台进行无创产前DNA检测会有更优异的表现。同时在运行无创产前DNA检测项目中,安诺优达采用独特的文库双质控流程,配合生物分析仪和荧光定量PCR仪对文库进行定性和定量的检测,避免了文库的其他DNA片段污染和不同样本间浓度的差异,可以在测序后提供更精准的检测结果。
转化医学网:除了您所谈及的无创产前DNA检测,这款测序仪还可以在其他方面有哪些应用?
陈重建博士:一机多用,能兼顾科研与临床,应用非常广泛。可应用于生殖生育领域:染色体异常检测、单基因疾病检测、胚胎植入前的遗传学筛查等;肿瘤诊治:血液病基因检测、乳腺癌基因检测、肿瘤个体化用药指导基因检测、ctDNA检测等。科研领域:可针对微生物、动植物基因等不同样本进行转录组测序、外显子组测序、RNA测序、表观基因组测序及全基因组测序等多种应用。
转化医学网:陈总,最后请您评价下NextSeq 550AR获批对贵公司的影响及国内无创产前DNA检测市场未来的发展?
陈重建博士:NextSeq550AR的获批,是安诺优达致力于在国内临床基因测序领域发展长期付出的收获,对于安诺优迖来说意义非凡。仪器的获批使得安诺优迖完成了临床测序领域产业链的布局,由单纯检测服务向上游测序仪和试剂拓展,成为集测序仪和试剂生产、检测服务提供为一体的公司,也为临床医生提供了一个更优质的测序平台。仪器获批是安诺优达的重要战略布局,也会进一步促进安诺优达在基因测序行业尤其NIPT项目的行业领先地位。
伴随着2016年10月卫计委发布了《国家卫生计生委办公厅关于规范有序开展孕妇外周血胎儿游离DNA产前筛查与诊断工作的通知》,中国的无创产前DNA检测行业不断完善,监管更加严格规范,使得厂家及医院对于无创产前DNA检测项目的开展更加有法可依,更加合理及合规,有利于进一步推动企业和医院的合作及项目推广。在未来几年内,无创产前DNA检测技术将会发展成孕期常规的一线筛查技术,会有更多的孕妇从中获益。
陈重建博士简介
研究员、北京市特聘专家,华中农业大学客座教授。生物技术和计算机学术背景,获得巴黎十一大学与中山大学双博士学位,在法国居里研究所完成博士后研究工作。目前担任北京市精准医疗与基因工程实验室主任,中国研究型医院学会血液病精准诊疗专业委员会副主任委员。先后被评为“北京市海聚工程人才”、“中关村十大海归创业新星”、“北京经济技术开发区领军人才”、“北京经济技术开发区海外高层次人才”、”2015-2016年北京市优秀创业企业家“,在Nature、Science、Elife、Developmental Cell、Genome Biology、Bioinformatics 等国际期刊发表学术论文19余篇。
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