上海生咨生物科技有限公司举办《蛋白质组学数据分析网络研习会》

2017年5月15日 8:00 至 2017年6月18日 18:00 ，上海生咨生物科技有限公司在 上海举办《蛋白质组学数据分析网络研习会》，会议大约有50人参加。

会议通知

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蛋白质组学数据分析网络研习会宣传图

 

日期	2017年5月15日－6月18日
方式	网络课件授课，网络直播答疑，一对一远程桌面共享帮助

 

蛋白质组学研究已经开展多年，基于凝胶的蛋白质组技术应用已经相对减少，而基于液相质谱技术的大规模蛋白质组学技术应用已经普及，除了人、大鼠、小鼠等模式生物研究中的应用之外，在植物、动物、微生物研究也已经广泛应用。至今，已有很多科研机构搭建起自己的蛋白质组实验平台，也有众多的专业的商业公司提供蛋白质组技术服务，采用shotgun、label-free、iTRAQ和TMT等技术方案的高通量蛋白质组数据大量产出，众多研究者手中已经拥有蛋白质的实验数据或者蛋白质组服务机构所提供的技术服务报告，还有更多的科研和工程人员正在或计划采用蛋白质组学技术进行科研探索。海量数据的获取似乎变的越来越容易，而实验的费用也日渐便宜，获取数据但问题是手中的一大堆蛋白质组数据如何去挖掘，服务机构给的报告怎么去解读，会不会也有茫然的时候？

 

• 从数据分析的角度如何进行实验的设计？

• 如何进行蛋白质组学数据分析，其整个分析流程是怎么样的？

• 通常蛋白质组学分析报告中通常会有哪些内容，怎么去解读？

• 常用的分析软件有哪些，这些软件能用做什么分析，产出的结果是怎么样的？

• 我不懂得写程序，又不想有问题就求别人，有哪些分析是能我完成的？

• 有哪些经典的文献和案例中的研究思路是可以让我借鉴的？

 

请参加我们为您精心设计的蛋白质组学数据分析网络研习会的课程吧，更低的学习成本，不逊于现场的学习效果。我们已经成功举办了很多期蛋白质组学专题的线下学习会，为了方便不便出差的朋友，本次活动将线下的学习会改为网络模式，并扩展的学习的内容，并邀请了具有非常丰富的实践经验的讲师录制讲课视屏和在线答疑。我们会根据课程进度，每周发布相应的课件给学员，大家可以灵活地选择学习时间及多次观看课件，实现高效的个性化学习。为了解决学习中碰到的问题，我们每周都安排了充裕的答疑时间，对于软件操作上的问题，安排了一对一的远程桌面共享指导解决。

• 课程内容实用，视屏课程可多次观看，不讲无法获取的商业软件，所选软件可免费获取；

• 学习时间相对自由，在每一周内可自行安排时间学习视频课件，而不影响平常的工作学习安排；

• 定制时间安排网络直播讨论和答疑，能更好的理解课程内容，与讲课老师和各位学员共同解决疑难问题；

• 一对一的远程上机辅导解决在实际操作软件碰的问题；

• 免除了学员额外的交通住宿费用和来回奔波之苦。

• 赶快报名吧，相信您一定会有的收获，18堂大课+6堂答疑课，良心活动，一定值您所付出的学费，谢谢！

上海生咨生物科技有限公司是由新加坡海归科研人员和资深生物医药信息学技术人员共同创办的以生物医药信息学服务和实验外包为主的高科技企业。公司致力于生物医药信息技术与软件的研发和服务，并结合合作伙伴的资源提供从技术咨询、实验设计、实验实施、数据分析一体的解决方案。公司的业务涉及基因组、转录组、蛋白质组和药物设计的研究解决方案。

会议日程 （最终日程以会议现场为准）

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课件发布日期	编号	主题	内容
第一周 2017年5月15日起	第一课	液质联用在蛋白质组学中的应用	‐ 蛋白质组学简介 ‐ 蛋白质组样品制备介绍 ‐ 蛋白质组学实验平台介绍 ‐ 蛋白质组学实验设计 ‐ 案例分析
	第二课	蛋白质组序列数据库和数据获取	‐ 蛋白质学研究中NCBI数据库中常用资料介绍 ‐ 采用batch entrez批量数据下载 ‐ NCBI网站的aspera软件的安装和数据下载 ‐ UniProt数据库简单介绍 ‐ UniProt数据批量下载
	第三课	蛋白质组学数据分析 搜索引擎	‐ 蛋白质组数据搜索的原理 ‐ 蛋白质组搜索引擎介绍 ‐ 蛋白质控，搜索结果解释和评估等 ‐ 蛋白标记定量和非标记定量 ‐ 一级质谱定量方法
	第四课	蛋白质组学质谱数据搜索上机操作	‐ MASCOT上机操作介绍 ‐ Search GUI安装和操作 ‐ Maxquant软件安装和上机操作介绍
	第五课	答疑及上机辅导	‐ 本周课程的答疑和上机辅导
第二周 2017年5月22日起	第六课	蛋白质组学数据分析	‐ 概述蛋白质组学数据分析能做一些什么 ‐ 展示结果是怎么样的
	第七课	表达数据分析	‐ 差异蛋白筛选方法操作 ‐ MeV软件层次聚类分析、kmeans聚类分析、主成分析上机
	第八课	简单热图绘制	‐ 热图绘制上机操作
	第九课	Domain和motif的预测	‐ Interproscan软件的介绍 ‐ Interproscan软件的安装和使用
	第十课	答疑及上机辅导	‐ 本周课程的答疑和上机辅导
课件发布日期	编号	主题	内容
第三周 2017年5月29日起	第十一课	Gene Ontology (GO)介绍	‐ Ontology介绍 ‐ GO注释 ‐ GO数据库介绍 ‐ GO主要文件格式介绍 ‐ GO相关的常用工具
	第十二课	基于ID的GO功能分析	‐ DAVID操作演示 ‐ GOEAST操作演示
	第十三课	基于序列的GO功能分析	‐ Blast2go软件安装和配置 ‐ Blast2go软件进行GO功能分析
	第十四课	GSEA功能分析	‐ GSEA软件安装和配置 ‐ GSEA软件分析和结果讲解
	第十五课	答疑及上机辅导
第四周 2017年6月5日起	第十六课	生物通路数据库介绍和常用工具使用	‐ KEGG，reactome, Biocyc, PID, biocarta介绍 ‐ KEGG mapper使用 ‐ KEGG Blastkoala使用
	第十七课	生物互作网络的可视化工具cytoscape介绍	‐ Cytoscape软件简介 ‐ 采用Cytoscape创建网络和文件格式 ‐ 导入外部数据表格和注释 ‐ 网络查询和过滤，网络排布设置 ‐ 网络的自定义风格化设置 ‐ App管理和BinGO插件 ‐ 网络合并和网络分析 ‐ 数据和图片导出
	第十八课	Cytoscape操作实例	蛋白质相互作用网络构建、分析和自定义风格化设置
	第十九课	蛋白相互作用数据库STRING的介绍和使用	STRING数据库介绍 STRING基本操作演示 STRING结合cytoscape软件进行网络构建和风格化设置
	第二十课	答疑及上机辅导	‐ 本周课程的答疑和上机辅导
第五周 2017年6月12日起	第二十一课	其它分析	维恩图绘制上机操作
	第二十二课	蛋白质组学案例分析及经典文献解读	蛋白质组学文章实例讲解
	第二十三课	答疑及上机辅导	‐ 本周课程的答疑和上机辅导
	第二十四课	答疑及上机辅导	整个活动的问题搜集、讨论、解答

注：课程安排不会有大的变化，但有可能会根据情况微调

授课老师

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戴文韬 博士 助理研究员 上海生物信息技术研究中心

2008年毕业于华东师范大学生命科学学院，获生物技术学士学位；同年进入中国科学院生物物理研究所硕博连读，2014年生物学（生物信息学）博士学位。2同年，在上海科学院上海生物信息技术研究中心担任助理研究员。2016年入选上海市科技英才扬帆计划。已完成工作包括：开发了处于领域内先进水平的蛋白质结构模型质量评估方法MEFTop和蛋白质结构预测程序FR-t5-M；利用自主研发的计算工具，参与骨肿瘤相关的RANKL新受体LGR4蛋白、白虎皮毛颜色遗传机制、耐药结核杆菌基因突变结构功能机制等合作研究，并负责计算生物学模拟和论文相应部分的撰写，相关工作被《Nature Medicine》、《Current Biology》等杂志接收发表；在理论方面，从疏水作用和氢键入手，参与发表了探索蛋白质折叠和空间组织模式与进化、功能关系的研究论文；在多组学数据整合分析方面，参与利用差异化网络分析研究了胃癌发展过程中的调控失常机理。

俞鸿 上海生咨生物科技有限公司

上海生咨生物科技有限公司创始人及技术总监，资深生物信息学工程师，具有超过15年生物信息学分析经验。参与了水稻基因组、家蚕基因组、人肝蛋白质组计划以及其他的国家973、863计划及国家自然科学基金等项目。在组学数据处理、基因/蛋白功能注释、生物信息学脚本编写、生物通路分析、相互作用网络模建等方面，有丰富的实际项目经验及独到见解。

吴谦 博士，副研究员，上海生物信息技术研究中心质谱平台负责人

具有超过15年质谱分析经验。硕士阶段发明了基于液体热膨胀原理的高精度梯度微流泵并应用于蛋白质组学研究，博士阶段主要从事癌症相关代谢组学及脂质组学研究。承担或参与上海市自然科学基金，国家自然科学基金，国家新药创制重大专项课题，国家重大科学仪器设备开发专项等多项课题。近年研究方向主要为蛋白质组学，代谢组学/脂质组学，遗传代谢病筛查等。

张扬　博士 复旦大学医学院高级工程师

十多年的生物信息学技术研究和实践经验，主要从事于疾病蛋白质组相关的生物信息学和系统生物学研究。经年的积累已对常规的生物信息学分析方法非常熟悉，并能根据实际需求开发出特殊的技术方法。对数据分析的方法、软件和算法开发、网络和硬件的管理方面等方面有多年的实践经验，尤其在蛋白质组学和糖组学方向有独到的见解，发表相关论文40多篇。

参会指南

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价格及相关事项

学习费：工业2600元/人，学术2200元/人。

享受优惠：同单位第二位及以上报名者，可享受85折优惠。

敬请注意：

1. 本次学习的课件视频及讲义资料会以最清晰的电子版形式提供给各位；

2. 为了照顾好每一位学员的学习质量，本次课程限额50名，感兴趣的同学请抓紧时间报名；

3. 由于本次课程时间长，我们不受理退款申请，您可以转让名额，谢谢理解；

4. 本次课程报名只是用于个人学习，请不要将讲课视频在公共场合播放，如果需要多人参加学习请分别报名，同单位第二人及以上可享受85折优惠价。

5. 讲课的课件、视频材料及其它课程相关材料的著作权归讲师所有，如果对内容有疑问，请与讲师联系，请勿传播、翻录。

6. 本次培训课件会上传到云盘供学员下载，为环保我们不提供光盘或U盘等实物存储介质。如果存在特殊情况不能正常下载的学员，请在活动期间及时联系我们，以寻找其它方式发送课件给您。

7. 本次视频课程进行了加密处理，观看之前请联系我们进行解密处理，并且解密后视频课程与您的电脑是绑定的，拷贝到其它电脑将无法观看，请务必放在您常用的电脑中观看。

8. 学习用的视频仅用于个人学习提高所用。根据之前的培训经验，我们建议您，如果在反复观看5次教学视频还是无法解决疑问，请及时将您的问题反馈给我们。

9. 视频加密有10次播放次数的限制，请安排好您的学习时间，如果存在特殊情况而现有学习次数不能够满足的情况，请在本次活动期间及时联系我们，我们会根据您所遇到的问题，重新给您视频观看的授权，或者提供其它有效的帮助。

10. 请您在付款前仔细阅读以上信息，若有任何疑问，请联系我们提出。若您没有异议，请付款，并将您的发票抬头、内容（会务费、会议费或技术服务费）和快递地址发给我们（发票信息及快递地址请您仔细检查），如有问题可与我们先沟通。我们会在收到款项后一周内为您开据等额发票，并快递给您。

免责声明：我司仅负责承办本会议，邀请讲师并进行活动的组织安排，不负责对学习的内容进行审核，如有侵犯第三方权益的内容，于我司无关，请尽快与讲师本人联系，也可联系我们代为转告。同时还请与会学员尊重第三方的权益，明确软件使用的范围（可能有些软件只限学术用户使用），如有侵权与我司无关。