上海遐永医药科技举办《TCGA,GEO生信高通量数据挖掘专题学习班2018（北京）》

2018年12月15日 8:00 至 2018年12月16日 18:00 ，上海遐永医药科技在 北京·金泰绿洲酒店·北京市东城区永外彭庄甲58号(陶然桥西南角)举办《TCGA,GEO生信高通量数据挖掘专题学习班2018（北京）》。

会议介绍

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TCGA,GEO生信高通量数据挖掘专题学习班2018（北京）宣传图

培训简介：

癌症是临床医学中非常重要的疾病方向。TCGA数据库中包含了常见了40种癌症方向（含30000个样本）的高通量数据及临床信息。大家对TCGA数据库的使用近几年也在逐渐增加！如图1所示。

图1 基于 pubmed数据库检索的包含“TCGA”发表的SCI 文章数量（2018年11月7日）

 

关键靶标分析是指基于生信的方法从高通量数据中挖掘到与研究方向最相关的靶标基因（mRNA，miRNA，lncRNA或蛋白）。

因此，需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力以及逻辑性的生信分析思路，从海量信息中获得自己想要的关键基因！

 

培训预期：

1. 通过整整两天的培训，掌握TCGA，GEO数据库的使用、下载及分析思路和实用操作知识点。

2. 可以独立完成一篇基于公共数据库的高通量数据挖掘分析。

3. 课后还可以赠送1小时的全场串联视频，用于学员的复习。

4. 赠送一份最近5年的高价值国自然标书（医药加高价值标书库里面选择）

5. 讲师团队赠送TCGA数据库甲基化，基因表达谱整合分析报告与疾病mRNA+lncRNA分析报告

 

学习班组织方

主办方：医药加平台

承办方：上海遐永医药科技有限公司

南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd），是专一服务于生命科学研究的专业技术型企业。是一大批志同道合的资深专业人士共同创办的具有现代化经营管理水平的生物高科技企业，从事生物技术产品的开发及销售，致力于将巴傲得生物打造成中国乃至世界一流的生物技术产品供应商。巴傲得生物长期备有Bioworld抗体现货4000多种抗体可以在一周左右送到客户的手里。精湛品质、合理价格、专业服务，是我们为您服务的宗旨。在细胞信号通路、免疫学、蛋白组学上拥有显著优势，其抗体产品、生长因子等为生命科学科研工作者提供了极大的便利。

会议日程 （最终日程以会议现场为准）

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时间安排		课程表	介绍
第 一 天	9:00~10:00	生信简介	生物信息介绍
			高通量：测序及芯片介绍——不同组学：转录组学、基因组学、表观组学、顺反组学、宏基因组学等。
			经典生信SCI文章的解读，了解TCGA数据库、GEO 数据库这些公共数据的挖掘获得创新结论并发文章的思路。
	10:15~12:00	TCGA数据库 NCBI GEO数据库	TCGA数据库：最全的癌症高通量数据公共库(简介)
			TCGA数据库的产生过程
			TCGA数据库的介绍和使用（包含了转录组、基因组、表观组和临床信息数据）
			GEO数据库介绍： 数据量最大的高通量公共数据库。
			GEO数据库的高通量芯片数据查找、筛选、探针转换、差异分析等。
	13:30~15:00	TCGA相关的下载工具	TCGA数据库癌症数据下载：RNA-seq数据、miRNA-seq数据、甲基化数据、基因组数据及临床信息数据的下载 TCGA数据书库癌症数据的处理，获得关键mRNA、miRNA的表达谱矩阵。
	15:20~17:00	TCGA相关的分析工具	TCGA数据分析——突变分析、差异分析、关联分析、生存分析、miRNA调控靶基因分析等。 获得生存曲线图（KM曲线，分为临床因素和基因表达两种KM曲线） miRNA靶基因结合位点。
第 二 天	8:30~12:00	TCGA数据的后续高级分析工具实战	功能富集分析——GO富集和KEGG pathway富集分析
			通路map图构建
			聚类热图制作
			蛋白互作分析（PPI）及网络图构建
			网络分析及hub蛋白/基因获得。
	13:30~15:00	TCGA数据库与GEO数据库挖掘	基于TCGA的lncRNA-miRNA-mRNA全转录组整合分析思路演练
			基于TCGA的甲基化与转录组整合分析思路演练
			基于TCGA的基因组与转录组整合分析思路演练
			基于GEO数据库多套数据整合（meta）分析思路演练
	15:20~16:30	整体演练	在电脑上快速完成从头到尾的一套数据实战，及答疑

 

示例图 通路富集分析结果图

示例图 GO富集分析结果图

示例图 聚类热图分析

 

示例图 蛋白互作网络图

 

示例图 pathway map图

示例图 关键基因的KM生存曲线图

示例图 venn图

会议嘉宾 （最终出席嘉宾以会议现场为准）

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讲师简介

宋伟博士

成果：参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建；完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。

研究方向：有近十年的生信分析经验，擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等，精通perl、R等编程语言。

培训经历：在上海、沈阳、济南、武汉等城市举办过十几场培训班。培训的对象有：医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。

培训方向：《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R语言培训》等

参会指南

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学习费2800元每位（学习费包含电子版教材、午餐，住宿费自理，保证学员完全掌握。）

优惠政策：

1. 提前支付转账的可提前拿到学习资料

2. 三人组团报名，每人收费2700元

3.  四人组团报名，每人收费2600元

4.  五人组团报名缴费，额外带一人免费注册！ 

5. 参加过医药加测序与芯片数据挖掘的学员只要再支付1000元

可以开正规会务发票，纸质邀请函（盖红章）。