为适应西部航运业的发展需要，重庆交通大学航运与船舶工程学院(前航海学院)2006年12月8日正式成立。学院目前开办有航海技术、轮机工程(轮机管理和动装设计与建造两个专业方向)、船舶与海洋工程、船舶电子电气工程四个本科专业，面向全国招收全日制本科学生。目前有一个一级学科硕士点，面向全国招收硕士研究生。由于学校专业学院的调整，学院于2015年改名为航运与船舶工程学院。重庆交通大学开办航海类、船舶类专业迄今已有近60年历史，培养了1.5万余名各层次毕业生，遍及我国各大航运与船舶企事业单位。2006年12月8日成立航海学院，经过多年的发展，航海学院已成为我国西部地区一流的高等航海和船舶教育基地。