珠海市地方税务局从原珠海市税务局分设出来，于1994年9月30日正式挂牌成立，1995年1月1日开始独立运转。2018年7月5日，国家税务总局珠海市税务局挂牌成立，标志着原珠海市国家税务局、原珠海市地方税务局正式合并。珠海市地方税务局(正处级建制)现内设办公室、法规科、税政科、规费管理科、征收管理科、计划财务科、信息管理科、人事教育科、机关党办、监察室(与纪检组合署办公)共10个职能科(室)和机关服务中心1个直属事业单位，下辖稽查局1个副处级直属行政单位和香洲区地方税务局、斗门区地方税务局、金湾区地方税务局、拱北地方税务局、保税区税务分局、高新区税务分局、珠海经济技术开发区地方税务局、征收分局