化合物参考型数据库是“十一五”中国科学院信息化专项，由中国科学院上海有机化学研究所联合过程工程研究所、长春应用化学研究所共同参与建设的化合物基础数据库，希望借助化学物质登录和常用化合物标识转换，支持基于化学物质的化学数据跨平台集成。化合物参考型数据库由化合物结构登录系统和化合物标识信息数据库两部分组成。化合物登录系统是一个基于算法的数据处理软件，提供化合物系统登录号（SRN）作为化学物质的唯一标识；化合物标识信息数据库保存已登录化合物的SRN、IUPAC 命名、结构、分子式等基本信息和其他标识信息。