重庆市农业科学院（Chongqing Academy of Agricultural Sciences）是重庆市人民政府的正厅局级农业科研公益一类事业单位。1958年5月，正式成立重庆市农业科学研究所。1960年10月，重庆市农业机械研究所建所。1997年，重庆市果树研究所、重庆市茶叶研究所分别划归重庆。2005年，正式组建重庆市农业科学院。据2023年9月研究院官网数据，重庆市农业科学院在共有职职工600余人；有专业研究所15个、重点实验室4个。1958年5月，西南农科所撤销，以留渝的10名科技人员为基础，于11月正式成立重庆市农业科学研究所。