船上污水处理系统是指对船舶产生的污水，包括船舶生活污水（黑水）、灰水以及船舶油污水，进行处理的装置系统。船舶产生的污水主要为包括船舶生活污水（黑水）、灰水以及船舶油污水。按照公约附则VI 的定义，船舶生活污水要是指：任何型式的厕所和小便池的排出物和其他废弃物；医务室（药房，病房等）的洗手池、洗澡盆和这些处所排水孔的排出物；装有活着的动物处所的排出物；混有上述定义的排出物的其它废水，船舶生活污水也常称为“黑水”；而灰水是指除黑水以外的船上产生的其他污水，主要是来自厨房、洗衣房以及盥洗室等处的废水和废物；船舶油污水主要包括船舶正常操作过程中产生的含油压载水、含油洗舱水和机舱水。