随机引物PCR(arbitrarilyprimedPCR，AP-PCR)是指在对模板顺序一无所知的情况下，通过随意设计或选择一个非特异性引物，在PCR反应体系中，首先在不严格条件下使引物与模板DNA中许多序列通过错配而复性。在理论上，并不一定要求整个引物都与模板复性，而只要引物的一部分特别是3'端有3-4个以上碱基与模板互补复性，既可使引物延伸。理论上，一旦在两条单链上相距一定距离且有反向复性引物存在，则可在TaqDNA聚合酶的作用下进行DNA片段的扩增，经1至数轮不严格条件下的PCR循环后，再于严格条件下进行扩增。经DNA测序凝胶电泳分离后，即可得到DNA指纹图，通过对不同来源基因指纹图之间